הערכות בישראל כי הנזק שנגרם למערך הנשק הכימי של אסד כתוצאה מהתקיפה האמריקאית־צרפתית־בריטית בסוריה הוא מזערי, וכי הצבא הסורי הספיק להיערך מבעוד מועד לתקיפה. גורמים ישראליים סבורים עוד כי מערכות ההגנה הסוריות הצליחו ליירט מספר טילים אמריקאיים.
במערכת הביטחון עוקבים אחר האויב המרכזי ‑ איראן ‑ וגורמי המודיעין מנסים להבין האם האיראנים יעמדו אחרי איומם להגיב לתקיפה המיוחסת לישראל בשדה התעופה 4־T. ההערכה המעודכנת בישראל היא שהאיראנים יגיבו לתקיפה, אך הם עדיין לא החליטו באיזו דרך. המכה שספגו האיראנים משמעותית ופגעה בניסיונותיהם להקים מערך אווירי על אדמת סוריה. גורם ביטחוני בכיר אומר כי ההרתעה הישראלית מול האיראנים חזקה הרבה יותר מהמשתקף בציבור הרחב.
גם ההצהרות של גורמים בכירים בישראל כי תגובה איראנית משמעותית תביא להפלתו של אסד נקלטה היטב בטהרן, בשל העובדה כי רה”מ נתניהו ושר הביטחון ליברמן עומדים מאחורי דבריהם למנוע התבססות איראנית בסוריה, ועל כן מחשבים באיראן את אופי התגובה.
לכן יש לראות את עיתוי הפרסום הישראלי, ולפיו המל"ט האיראני נשא חומר נפץ ומטרתו הייתה לבצע פעולת חבלה בשטח ישראל, בהקשר הזה. המל"ט שחדר לשטח ישראל מסוריה לפני כחודשיים היה בדרכו לבצע פעולת חבלה בשטח המדינה. בצה"ל הגיעו למסקנה זו על סמך ניתוח מסלול התעופה של המל"ט וחקירת שבריו שנאספו. בצה"ל הבהירו כי המל"ט היה במעקב ולא היווה סכנה. ישראל מודאגת משני דברים: הראשון, יציאה מהירה יותר של האמריקאים מסוריה אחרי התקיפה בבחינת “עשינו את שלנו ואנחנו יכולים להתקפל”, והשני בפן המבצעי ‑ הודעת שר ההגנה הרוסי כי ימכור מערכות הגנה מתקדמות מסוג S-300 לסוריה.
כיום יש בסוריה מערכות כאלה בידי הרוסים והן אינן פועלות נגד מטוסי חיל האוויר. אם אכן יגיעו מערכות כאלה לאסד הן יקשו באופן דרמטי על חופש הפעולה של ישראל. עובדה זו תציב את ישראל בפני דילמה ‑ האם לתקוף אותן מערכות לפני שהן הופכות מבצעיות בסוריה.
